Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOSBP53539 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOSBP53539 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOSBP53539 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOSBP53539 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOSBP53539 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOSBP53539 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOSBP53539 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOSBP53539 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOSBP53539 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOSBP53539 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOSBP53539 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOSBP53539 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOSBP53539 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOSBP53539 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOSBP53539 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FOSBP53539 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOSBP53539 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOSBP53539 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOSBP53539 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOSBP53539 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOSBP53539 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOSBP53539 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOSBP53539 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOSBP53539 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOSBP53539 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOSBP53539 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOSBP53539 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOSBP53539 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOSBP53539 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOSBP53539 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms