Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LUMP51884 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LUMP51884 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LUMP51884 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms