Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCAMP50895 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCAMP50895 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAMP50895 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAMP50895 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAMP50895 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAMP50895 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAMP50895 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAMP50895 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAMP50895 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAMP50895 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAMP50895 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAMP50895 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAMP50895 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAMP50895 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAMP50895 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BCAMP50895 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCAMP50895 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BCAMP50895 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCAMP50895 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCAMP50895 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCAMP50895 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCAMP50895 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BCAMP50895 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAMP50895 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAMP50895 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BCAMP50895 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms