Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERFP50548 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERFP50548 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERFP50548 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERFP50548 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERFP50548 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERFP50548 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERFP50548 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERFP50548 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERFP50548 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERFP50548 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERFP50548 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERFP50548 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERFP50548 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERFP50548 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERFP50548 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERFP50548 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERFP50548 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERFP50548 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERFP50548 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms