Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UTRNP46939 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UTRNP46939 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UTRNP46939 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UTRNP46939 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UTRNP46939 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UTRNP46939 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UTRNP46939 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UTRNP46939 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UTRNP46939 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UTRNP46939 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UTRNP46939 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UTRNP46939 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UTRNP46939 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTRNP46939 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTRNP46939 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTRNP46939 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTRNP46939 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTRNP46939 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTRNP46939 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTRNP46939 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTRNP46939 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTRNP46939 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTRNP46939 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTRNP46939 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTRNP46939 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTRNP46939 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTRNP46939 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTRNP46939 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTRNP46939 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTRNP46939 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UTRNP46939 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTRNP46939 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTRNP46939 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTRNP46939 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTRNP46939 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTRNP46939 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTRNP46939 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTRNP46939 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UTRNP46939 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTRNP46939 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTRNP46939 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTRNP46939 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTRNP46939 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTRNP46939 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UTRNP46939 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UTRNP46939 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UTRNP46939 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UTRNP46939 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UTRNP46939 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UTRNP46939 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UTRNP46939 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UTRNP46939 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UTRNP46939 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UTRNP46939 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UTRNP46939 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UTRNP46939 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UTRNP46939 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UTRNP46939 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UTRNP46939 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UTRNP46939 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UTRNP46939 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UTRNP46939 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UTRNP46939 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UTRNP46939 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UTRNP46939 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UTRNP46939 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UTRNP46939 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UTRNP46939 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UTRNP46939 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTRNP46939 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTRNP46939 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTRNP46939 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTRNP46939 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTRNP46939 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTRNP46939 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTRNP46939 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTRNP46939 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTRNP46939 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTRNP46939 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTRNP46939 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTRNP46939 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTRNP46939 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms