Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RANGAP1P46060 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RANGAP1P46060 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms