Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV4P43268 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV4P43268 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV4P43268 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV4P43268 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV4P43268 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV4P43268 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV4P43268 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV4P43268 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV4P43268 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ETV4P43268 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ETV4P43268 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms