Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCAMP43121 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCAMP43121 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCAMP43121 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MCAMP43121 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCAMP43121 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms