Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOBEC1P41238 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC1P41238 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms