Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNCAP37840 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNCAP37840 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNCAP37840 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNCAP37840 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SNCAP37840 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNCAP37840 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNCAP37840 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNCAP37840 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNCAP37840 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNCAP37840 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNCAP37840 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNCAP37840 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNCAP37840 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNCAP37840 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNCAP37840 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms