Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CHI3L1P36222 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CHI3L1P36222 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms