Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFTPDP35247 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms