Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCGF2P35227 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms