Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNGA1P29973 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms