Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMBRP28336 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMBRP28336 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMBRP28336 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMBRP28336 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms