Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms