Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL3RAP26951 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms