Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTFP26441 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNTFP26441 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CNTFP26441 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CNTFP26441 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CNTFP26441 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CNTFP26441 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTFP26441 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFP26441 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFP26441 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFP26441 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFP26441 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFP26441 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFP26441 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFP26441 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFP26441 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFP26441 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFP26441 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFP26441 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTFP26441 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms