Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABRR1P24046 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms