Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRDP23468 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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