Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LMNB1P20700 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMNB1P20700 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms