Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TNNI3P19429 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms