Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCLP18206 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCLP18206 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VCLP18206 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCLP18206 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCLP18206 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCLP18206 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCLP18206 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCLP18206 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCLP18206 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCLP18206 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCLP18206 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCLP18206 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCLP18206 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCLP18206 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCLP18206 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCLP18206 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VCLP18206 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VCLP18206 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VCLP18206 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms