Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA4P13612 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITGA4P13612 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms