Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL6A2P12110 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL6A2P12110 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL6A2P12110 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL6A2P12110 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL6A2P12110 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL6A2P12110 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COL6A2P12110 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL6A2P12110 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL6A2P12110 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COL6A2P12110 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL6A2P12110 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL6A2P12110 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL6A2P12110 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL6A2P12110 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COL6A2P12110 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COL6A2P12110 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms