Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFTPCP11686 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SFTPCP11686 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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