Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NGFRP08138 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NGFRP08138 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NGFRP08138 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NGFRP08138 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NGFRP08138 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NGFRP08138 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NGFRP08138 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NGFRP08138 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NGFRP08138 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NGFRP08138 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NGFRP08138 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NGFRP08138 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms