Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTSLP07711 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CTSLP07711 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
CTSLP07711 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSLP07711 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSLP07711 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSLP07711 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSLP07711 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSLP07711 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSLP07711 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSLP07711 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSLP07711 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSLP07711 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSLP07711 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSLP07711 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSLP07711 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSLP07711 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSLP07711 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSLP07711 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms