Protein–RNA interactions for Protein: P05813

CRYBA1, Beta-crystallin A3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA1P05813 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRYBA1P05813 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA1P05813 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRYBA1P05813 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms