Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGFRP00533 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGFRP00533 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGFRP00533 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGFRP00533 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGFRP00533 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGFRP00533 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGFRP00533 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGFRP00533 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGFRP00533 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGFRP00533 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGFRP00533 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGFRP00533 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGFRP00533 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EGFRP00533 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGFRP00533 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGFRP00533 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGFRP00533 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EGFRP00533 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EGFRP00533 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EGFRP00533 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EGFRP00533 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms