Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX6O95503 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX6O95503 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX6O95503 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX6O95503 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX6O95503 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX6O95503 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX6O95503 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX6O95503 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX6O95503 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms