Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3JO75822 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms