Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ITGA10O75578 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms