Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF5BO60841 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF5BO60841 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms