Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GMDSO60547 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GMDSO60547 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GMDSO60547 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GMDSO60547 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms