Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EDIL3O43854 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EDIL3O43854 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms