Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTDSPLO15194 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms