Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIMBP2O15034 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIMBP2O15034 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms