Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTDSP2O14595 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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