Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PIK3C2AO00443 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIK3C2AO00443 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms