Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms