Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HIP1O00291 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HIP1O00291 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIP1O00291 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIP1O00291 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIP1O00291 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIP1O00291 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIP1O00291 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIP1O00291 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIP1O00291 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIP1O00291 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIP1O00291 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIP1O00291 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIP1O00291 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIP1O00291 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIP1O00291 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms