Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E9PBE3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E9PBE3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E9PBE3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E9PBE3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E9PBE3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E9PBE3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
E9PBE3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E9PBE3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E9PBE3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
E9PBE3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E9PBE3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
E9PBE3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E9PBE3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E9PBE3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E9PBE3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E9PBE3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E9PBE3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E9PBE3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E9PBE3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E9PBE3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E9PBE3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E9PBE3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E9PBE3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E9PBE3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E9PBE3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E9PBE3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E9PBE3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
E9PBE3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
E9PBE3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
E9PBE3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
E9PBE3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
E9PBE3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms