Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MCRIP1C9JLW8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MCRIP1C9JLW8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms