Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP17L13C9JLJ4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP17L13C9JLJ4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms