Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NOTOA8MTQ0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms