Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TTLL13PA6NNM8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TTLL13PA6NNM8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms