Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMX3A6NHT5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms