Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAMB4A4D0S4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMB4A4D0S4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms