Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
A3GALT2U3KPV4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A3GALT2U3KPV4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A3GALT2U3KPV4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A3GALT2U3KPV4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A3GALT2U3KPV4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A3GALT2U3KPV4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A3GALT2U3KPV4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
A3GALT2U3KPV4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
A3GALT2U3KPV4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A3GALT2U3KPV4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A3GALT2U3KPV4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A3GALT2U3KPV4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A3GALT2U3KPV4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
A3GALT2U3KPV4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
A3GALT2U3KPV4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms